Modelación en Biología bajo un Enfoque de Sistemas Complejos

Curso | 2021-1

Posgrado de Ciencias Biomédicas

Tópico selecto

Modelación en Biología bajo un Enfoque de Sistemas Complejos


Inicio: 3era semana de septiembre

Cita para definir horario: 18 de septiembre a las 13 horas.


Informes: mekler@icf.unam.mx


Descripción:
El propósito del curso es trasmitir una experiencia acumulada de varias décadas de investigación sobre la modelización de fenómenos biológicos. El curso se centrará sobre los temas de enumerados en el temario. Se buscará integrar el material resaltando puntos en común tanto conceptuales como metodológicos, se trata de proyectos interdisciplinarios donde la analogía es una componente fundamental. A medida que se vayan presentando las investigaciones se abordará la biología, matemática, física y cómputo necesarios para darle seguimiento. En algunos de los temas se comentará sobre trabajo experimental y de campo realizado por coautores de las publicaciones. Se busca familiarizar a los alumnos con aspectos de la biología sistemas y la biología teórica con base en la elaboración de modelos.

La biología cuantitativa es una línea de investigación de frontera que tiene multitud de variantes, en el curso se plantean algunas de ellas. El enfoque de sistemas complejos es recurrente.

Se requiere de un conocimiento básico de ecuaciones diferenciales y programación.



Temario
Modelación de:

1) Fecundación de invertebrados marinos y mamíferos. (redes lógicas de regulación determinísticas e híbridas, sistemas de ecuaciones diferenciales ordinarias acopladas).

2) Diferenciación Celular en embriones de Xenopus Laevis (ecuaciones diferenciales acopladas y mapeos acoplados)

3) Evolución de sequencias geneticas en el ciclo reproductivo de VIH (mapeos acoplados, ecuaciones estocáticas)

4) Origen del código genético (ecuaciones diferenciales en potenciales aleatorios)

5) Sucesión ecológica en paleolagos (análisis de series, propiedades de invarianza de escala)


A lo largo del curso se introducirán los metodos y conceptos de dinámica no lineal, procesos estocásticos, teoría de redes y física que se vayan requiriendo según el tema de estudio.